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論文・総説

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日本語・英語の総説等（2000年〜）

• Miyazaki, R., and Akiyama, Y. (2023)
  Analyzing protein intermediate interactions in living E. coli cells using site-specific photo-crosslinking combined with chemical crosslinking
  STAR Protocols, 4, 102178.
  DOI: 10.1016/j.xpro.2023.102178
• Miyazaki, R., Mori, H., and Akiyama, Y. (2022)
  A photo-crosslinking approach to monitor assembly of an LptD intermediate with LptE in a living cell.
  Lipopolysaccharide Transport-Methods and Protocols, Methods Mol. Biol. 2548, 97-107.
  DOI: 10.1007/978-1-0716-2581-1_7
• 宮﨑亮次、森博幸、秋山芳展 (2021)
  PiXie法による細胞内タンパク質の迅速な相互作用・フォールディング解析
  生物物理 61, 036-039.
• Miyata, M., Robinson, R. C., Uyeda, T. Q. P., Fukumori, Y., Fukushima, S., Haruta, S., Homma, M., Inaba, K., Ito, M., Kaito, C., Kato, K., Kenri, T., Kinoshita, Y., Kojima, S., Minamino, T., Mori, H., Nakamura, S., Nakane, D., Nakayama, K., Nishiyama, M., Shibata, S., Shimabukuro, K., Tamakoshi, M., Taoka, A., Tashiro, Y., Tulum, I., Wada, H. and Wakabayashi, K. (2020)
  Tree of motility – A proposed history of motility systems in the tree of life.
  Genes to Cells 25, 6-21.
• Miyazaki, R., Akiyama, Y., and Mori, H. (2020)
  A photo-cross-linking approach to monitor protein dynamics in living cells.
  Biochim. Biophys. Acta-Gen. Subj. 1864, 129317.
  DOI: 10.1016/j.bbagen.2019.03.003
• 秋山芳展 (2019)
  大腸菌表層ストレス応答：インプットとアウトプットに働くプロテアーゼの機能
  IFO Res. Commun. 33, 217-220.
• 檜作洋平（2019）
  膜内切断プロテアーゼの基質認識・切断機構
  生物物理 59 (2), 79-83.
• Ito, K., Mori, H. and Chiba, S. (2018)
  Monitoring substrate enables real-time regulation of a protein localization pathway.
  FEMS Microbiol. Lett., vol 365, issue 11.
• 石井英治、森博幸（2017）
  ビブリオ属細菌における２つのタンパク質膜透過促進因子の生理的意義と使い分け機構.
  医学のあゆみ 261, 1178-1179.
• Hizukuri, Y., Akiyama, K. and Akiyama, Y. (2017)
  Biochemical Characterization of Function and Structure of RseP, an Escherichia coli S2P Protease.
  Enzymology at the Membrane Interface: Intramembrane Proteases. Edited by Michael H. Gelb., Methods Enzymol., vol 584, pp 1-33.
• 檜作洋平、秋山芳展（2015）
  膜内部でのタンパク質分解とストレス応答制御
  別冊・医学のあゆみ 「レドックスUPDATE ―ストレス制御の臨床医学・健康医学」（監修：平家俊男、淀井淳司） 医歯薬出版株式会社 pp 69-74.
• 秋山芳展（2014）
  細菌表層ストレス応答システムの新機能の解明
  IFO Res. Commun. 28, 51-69.
• Kroos, L. and Akiyama, Y. (2013)
  Biochemical and structural insights into intramembrane metalloprotease mechanisms.
  Biochim. Biophys. Acta. 1828, 2873-2885.
• Ha, Y., Akiyama, Y. and Xue, Y. (2013)
  Structure and mechanism of rhomboid protease.
  J Boil Chem. 288, 15430-6.
• 森 博幸、 塚崎智也（2013）
  細菌のタンパク質分泌を促進する膜タンパクSecDFの構造と機能
  化学と生物　51, 28-35.
• Hizukuri, Y., Ito, K. and Akiyama, Y. (2013)
  RseP peptidase.
  Handbook of Proteolytic Enzymes, 3rd ed. (ed. Rawlings, N. D. and Salvesen, G.)
  Elsevier Ltd. pp1546-1550.
• Ogura, T., Okuno, T., Suno, R. and Akiyama, Y. (2013)
  FtsH protease.
  Handbook of Proteolytic Enzymes, 3rd ed. (ed. Rawlings, N. D. and Salvesen, G.)
  Elsevier Ltd. pp685-692.
• Akiyama, Y. and Ito, K. (2013)
  HtpX peptidase.
  Handbook of Proteolytic Enzymes, 3rd ed. (ed. Rawlings, N. D. and Salvesen, G.)
  Elsevier Ltd. pp 683-685.
• Narita, S. (2011)
  ABC Transporters Involved in the Biogenesis of the Outer Membrane in Gram-Negative Bacteria.
  Biosci. Biotechnol. Biochem. 75, 1044-1054.
• Ito, K and Mori, H. (2009)
  The Sec Protein Secretion System
  Bacterial Secreted Proteins (ed. K. Wooldridge) pp. 3-22.
  Caister Academic Press, Norfolk, UK
• 森　博幸 （2009）
  立体構造解析からみえてきたSecAによる蛋白質の膜透過の駆動機構
  蛋白質核酸酵素 54, 685-695.
• Akiyama, Y. (2009)
  Quality control of cytoplasmic membrane proteins in Escherichia coli.
  J Biochem. 146. 449-454.
• 秋山芳展 （2008）
  DegS
  「キーワード：タンパク質の一生」蛋白質核酸酵素（増刊）53, 1038.
• 秋山芳展 （2008）
  DegP
  「キーワード：タンパク質の一生」蛋白質核酸酵素（増刊）53, 1037.
• 秋山芳展 （2008）
  表層ストレス応答
  「キーワード：タンパク質の一生」蛋白質核酸酵素（増刊）53, 985.
• 秋山芳展 （2008）
  ペリプラズム
  「キーワード：タンパク質の一生」蛋白質核酸酵素（増刊）53, 1000.
• 伊藤維昭 （2008）
  表現模写
  「キーワード：タンパク質の一生」蛋白質核酸酵素（増刊）53, 984.
• 伊藤維昭 （2008）
  ポリペプチド鎖排出トンネル
  「キーワード：タンパク質の一生」蛋白質核酸酵素（増刊）53, 1003.
• 伊藤維昭 （2008）
  RpoH
  「キーワード：タンパク質の一生」蛋白質核酸酵素（増刊）53, 1081.
• 伊藤維昭 （2008）
  Sec経路
  「キーワード：タンパク質の一生」蛋白質核酸酵素（増刊）53, 1082.
• 伊藤維昭 （2008）
  Secトランスロコン
  「キーワード：タンパク質の一生」蛋白質核酸酵素（増刊）53, 1082-1083.
• 伊藤維昭 （2008）
  SecA
  「キーワード：タンパク質の一生」蛋白質核酸酵素（増刊）53, 1085.
• 伊藤維昭 （2008）
  SecB
  「キーワード：タンパク質の一生」蛋白質核酸酵素（増刊）53, 1086.
• 伊藤維昭 （2008）
  SecM
  「キーワード：タンパク質の一生」蛋白質核酸酵素（増刊）53, 1087.
• Ito, K. and Inaba, K. (2008)
  The disulfide bond formation (Dsb) system.
  Curr. Opin. Struct. Biol. 18. 450-458.
• Inaba, K. and Ito, K. (2008)
  Structure and mechanisms of the DsbB-DsbA disulfide bond generation machine.
  Biochim. Biophys. Acta. 1783. 520-529.
• 前河早希、秋山芳展 （2008）
  Rhomboidプロテアーゼの細胞機能と作用機構
  Cognition and Dementia 7, 32-39.
• 秋山芳展 （2007）
  水と油のコラボ：膜タンパク質の加水分解
  「タンパク質の一生集中マスター　細胞における成熟・輸送・品質管理」 p139.
• 森　博幸 （2006）
  背中合わせより向かい合わせのほうが好都合？：トランスロコンのアセンブリー様式
  蛋白質核酸酵素 51, 169-170.
• 酒向万智子、秋山芳展 （2005）
  大腸菌の膜タンパク質分解
  実験医学　23, 2358-2362.
• Ito, K. and Akiyama, Y. (2005)
  Cellular functions, mechanism of action, and regulation of FtsH protease.
  Annu. Rev. Microbiol. 59, 211-231.
• 秋山芳展 （2004）
  大腸菌表層蛋白質の品質管理
  蛋白質核酸酵素　49, 1054-1058.
• 千葉志信、秋山芳展 （2004）
  大腸菌膜プロテアーゼによる膜の品質管理とストレス応答調節
  化学と生物　42, 86-92.
• 森　博幸 （2004）
  タンパク質膜透過装置の新しい流れ；構造生物学の時代へ
  蛋白質核酸酵素
  （増刊「細胞における蛋白質の一生」生成・成熟・輸送・管理・分解・病態） 7, 950-958.
• Akiyama, Y., Ito, K and Ogura, T. (2004)
  FtsH protease.
  pp. 794-798, Handbook of Proteolytic Enzymes 2nd Ed., Elsevier
• 金原和江、秋山芳展 （2003）
  膜内部での蛋白質切断 (RIP) によるシグナル分子の生成　細菌から高等生物まで
  蛋白質核酸酵素　48, 836-841.
• 才川直哉、秋山芳展 （2003）
  AAAプロテアーゼによる大腸菌膜タンパク質の品質管理
  バイオサイエンスとインダストリー　61, 306-311.
• 森　博幸 （2003）
  ピストンモータ SecA の構造
  蛋白質核酸酵素 48, 159-160.
• Mori, H. and Ito, K. (2001)
  The Sec protein-translocation pathway.
  Trends Microbiol. 9, 494-500.
• 小椋　光、唐田清伸、千葉志信、秋山芳展 (2001)
  AAAプロテアーゼ
  蛋白質核酸酵素 46, 1679-1685.
• 森　博幸 （2001）
  ヌクレオチド結合モチーフ A
  生体の科学　モチーフドメインリスト 52, 422-423.

日本語の総説等（1996〜1999年）

• 小椋光、多賀也光男、友安俊文、伊藤維昭、秋山芳展、中井俊樹、大隅隆、塚本利朗（1996）
  AAAスーパーファミリータンパク質－新しいATPaseファミリーの構造とその多様な機能
  細胞工学15, 968-980.